La Présidente Zuzana Čaputová n'est pas habilitée à donner son approbation en ce qui concerne la nomination du représentant de la République slovaque à la Cour des comptes européenne. Cependant, elle a attiré l'attention du Premier ministre provisoirement nommé Eduard Heger sur la nécessité de tenir compte des critères d'expertise des candidats dans chaque nomination. Celle-ci est approuvée par le gouvernement sans l'accord préalable du chef de l'État, car il s'agit d'une compétence basée sur les conventions internationales. Cependant, selon la Présidente, chaque nomination doit tenir compte des critères établis pour l'expertise des candidats, car il est également nécessaire d'éviter un risque potentiel de réputation pour la Slovaquie devant les organisations internationales.
Des représentants du parti de gauche Smer-SD ont fait appel mercredi 1er février à la Présidente pour qu'elle s'occupe de la nomination du député Martin Klus comme candidat au poste de membre de la Cour des comptes européenne. Ils y voient la corruption et le manque d'expérience dans le domaine du député. D’autres membres non affiliés du Conseil national slovaque ont à leur tour appelé Martin Klus à retirer son consentement à la nomination, parlant de la corruption du gouvernement. Martin Klus a précisé que sa formation postuniversitaire était de nature économique et a ajouté que la Cour des comptes européenne est une institution politique de l'Union européenne, ajoutant que le Parlement européen et le Conseil de l'UE seront les derniers à décider de sa nomination.
